目次

第1章　生命科学
　1ー1　原核細胞と真核細胞：細胞の分類とウイルス
　1ー2　細胞内小器官：細胞内小器官とその役割
　1ー3　細胞周期：細胞分裂と細胞周期
　1ー4　DNAの複製：ゲノムDNAの半保存的複製
　1ー5　転写：ゲノムDNAからのさまざまなRNAの合成
　1ー6　翻訳：タンパク質の生合成
　1ー7　核酸の構造と機能：DNAとRNAの構造と機能
　1ー8　アミノ酸の構造と性質：20種類の生体アミノ酸の構造と性質
　1ー9　タンパク質の階層構造：タンパク質の役割と一次〜四次構造
　1ー10　生体膜と膜タンパク質：生体膜の構造と膜タンパク質の機能
　1ー11　翻訳後修飾：タンパク質の翻訳後修飾とその役割
　1ー12　免疫と代謝：抗体による免疫・生体内物質の代謝パスウェイ
　1ー13　シグナル伝達：細胞間のシグナル伝達によるコミュニケーショ
　ン
　1ー14　遺伝：メンデルの法則による遺伝子の世代間継承
　1ー15　ゲノムと生物：生物ゲノムのサイズと遺伝子地図
　1ー16　ヒトゲノム：ヒトゲノムの構造と遺伝的多型
　1ー17　遺伝子組換え：主要な遺伝子組換え技術
　1ー18　ゲノム解析：ショットガン法による全ゲノム解読とゲノムワイ
　ド解析技術
　1ー19　分子生物学実験技術：分子生物学分野を飛躍的に発展させた実
　験技術
　1ー20　分子・細胞生物学実験技術：分子・細胞生物学の最新の実験技
　術
　1ー21　タンパク質の立体構造決定：X線結晶解析法などによるタンパ
　ク質の立体構造の解析技術
　1ー22　生命科学研究のための法令・指針：生命科学研究の実施にあた
　り遵守すべき法令・研究倫理指針
　
第2章　計算科学
　2ー1　2進数：2進数と論理演算
　2ー2　論理回路：論理回路によるコンピュータ上の論理演算
　2ー3　プログラミング言語：コンピュータのプログラミング言語と計
　算の実行
　2ー4　マークアップ言語：XMLなどのマークアップ言語によるデータ
　記述
　2ー5　プロトコル：ネットワークの通信プロトコルとセキュリティ
　2ー6　データ構造：プログラム内の代表的なデータ構造
　2ー7　二分探索：高速にデータを検索する二分探索アルゴリズム
　2ー8　ソートアルゴリズム：高速にデータを並べ替えるソートアルゴ
　リズム
　2ー9　バブルソート：基本的なバブルソートのアルゴリズム
　2ー10　オートマトン：オートマトンによる状態・遷移データの表現
　2ー11　リレーショナルデータベース：リレーショナルデータベースに
　よるデータの整理
　2ー12　SQL：SQLによるリレーショナルデータベースの操作
　2ー13　正規分布：正規分布の性質
　2ー14　独立性：確率分布と独立性・ベイズ推定
　2ー15　統計的検定：統計的検定による仮説の検証
　2ー16　最尤推定：確率分布の最尤法による推定
　2ー17　機械学習：機械学習とデータマイニング
　2ー18　関数最適化：機械学習のための関数最適化
　2ー19　深層学習：深層学習
　2ー20　クラスタリング：k平均法によるデータのクラスタリング
　2ー21　機械学習の評価：感度・特異度による予測法の評価
　2ー22　交差検証：クロスバリデーション（交差検証）による予測法の
　評価
　
第3章　配列解析
　3ー1　分子生物学データベース：国際的な公共の分子生物学データ
　ベース
　3ー2　配列アラインメント：動的計画法による配列アラインメントの
　計算
　3ー3　スコア行列：アミノ酸の類似性スコアとその統計的評価
　3ー4　高速な類似配列検索：高速に配列を比較するための計算技術
　3ー5　ホモロジー検索：高速にホモロジー検索するためのプログラム
　3ー6　マルチプルアラインメント：マルチプルアラインメントによる
　配列の多重比較
　3ー7　モチーフ：保存された配列パターン（配列モチーフ）の解析
　3ー8　ゲノムプロジェクトと遺伝子予測：ゲノム解読と遺伝子予測に
　よるアノテーション
　3ー9　タンパク質の機能予測：タンパク質の生理学的機能の予測
　3ー10　RNAの二次構造予測：RNAのもつ二次構造とその予測法
　3ー11　ゲノム特徴抽出：ゲノム配列の塩基組成などに基づく特徴抽出
　3ー12　ゲノム比較：ゲノム配列の比較解析とオーソログ解析
　
第4章　構造解析
　4ー1　構造化学：ペプチド結合の構造化学
　4ー2　タンパク質の立体構造：タンパク質立体構造の形成と分子グラ
　フィックス表現
　4ー3　構造モチーフ：タンパク質立体構造中の超二次構造と構造モ
　チーフ
　4ー4　構造分類：タンパク質立体構造の分類
　4ー5　その他の生体分子の立体構造：DNAとRNAの立体構造
　4ー6　立体構造データベース：立体構造データベースPDBとPDB
　フォーマット
　4ー7　立体構造の比較：立体構造を構造重ね合わせにより比較する方
　法
　4ー8　タンパク質立体構造の保存性分析：構造重ね合わせによるタン
　パク質立体構造の保存性分析
　4ー9　相互作用分析：タンパク質立体構造による相互作用分析
　4ー10　マップ分析：タンパク質立体構造のマップ分析
　4ー11　立体構造予測：タンパク質の立体構造を予測する方法
　4ー12　分子動力学法：分子動力学法による分子運動のシミュレーショ
　ン
　4ー13　ケモインフォマティクス：ケモインフォマティクスによる低分
　子化合物の情報処理
　4ー14　電子顕微鏡のインフォマティクス：電子顕微鏡のインフォマ
　ティクス
　4ー15　タンパク質デザイン：望みの立体構造や機能を有するタンパク
　質をデザインする方法
　
第5章　遺伝・進化解析
　5ー1　ハーディー・ワインベルク平衡：対立遺伝子頻度のハーディ
　ー・ワインベルク平衡
　5ー2　連鎖解析：連鎖解析による遺伝子座の探索
　5ー3　遺伝子マーカー：遺伝的多型と遺伝子マーカーとしての利用
　5ー4　ゲノムワイド関連解析：ゲノムワイド関連解析（GWAS）によ
　る遺伝子の探索
　5ー5　分子疫学・個別化医療：ハプロタイプ解析や遺伝子パネル検査
　による分子疫学と個別化医療
　5ー6　分子進化：分子進化の中立説と分子時計
　5ー7　進化系統樹：進化系統樹の表現方法
　5ー8　パラログ・オーソログ：進化系統樹によるホモログ・パラロ
　グ・オーソログの解析
　5ー9　系統推定アルゴリズム：系統樹をつくるための系統推定アルゴ
　リズム
　
第6章　オーミクス解析
　6ー1　オーミクス解析の手法：オーミクス解析に用いる研究手法
　6ー2　サンガー法・次世代シークエンシング：サンガー法および次世
　代・超並列シークエンシング技術
　6ー3　DNAマイクロアレイ・NGSの応用解析：DNAマイクロアレイと
　次世代シークエンシング技術による応用解析
　6ー4　メタボローム解析：メタボローム解析・メタボロミクス
　6ー5　プロテオーム解析：プロテオーム解析・プロテオミクス
　6ー6　タンパク質間相互作用 ：タンパク質間相互作用の大量解析手法
　6ー7　遺伝子発現クラスタリング：遺伝子発現パターンによるサンプ
　ルのクラスタリング
　6ー8　微分方程式：微分方程式による遺伝子発現量の変動予測
　6ー9　システム安定性：固有値の分析によるシステムの安定性解析
　6ー10　ネットワークの構造と性質：ネットワークの構造とダイナミク
　ス
　
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